Le professeur du Département des maladies infectieuses de l’Imperial College London et professeur au CEU UCH, José R. Penadés, dirige l’équipe qui a testé le système innovant d’intelligence artificielle développé par Google, appelé « AI co-scientist », capable de proposer des hypothèses de haute valeur scientifique.
Le professeur du Département des maladies infectieuses de l’Imperial College London et professeur à l’université CEU Cardenal Herrera (CEU UCH) de Valence, José R. Penadés, dirige l’un des groupes qui ont participé à la validation de la plateforme « AI co-scientist », que Google vient de présenter au niveau mondial. Ce système innovant d’intelligence artificielle a été conçu pour fonctionner comme un chercheur, en générant des hypothèses de grande valeur scientifique et en accélérant le processus de découverte dans le domaine de la science.
Le résultat de cette validation a été surprenant et très positif, comme le souligne le Dr Penadés : « La validation d’une hypothèse générée par l’IA peut prendre des années. C’est pourquoi, lorsque Google nous a demandé de collaborer au test de sa plateforme d’IA scientifique, nous avons décidé de l’évaluer avec une question dont nous connaissions déjà la réponse grâce à un travail expérimental approfondi qui n’avait pas encore été publié. Cette étude, qui est sur le point d’être publiée dans l’une des plus importantes revues scientifiques au monde, n’était pas encore connue de la communauté des chercheurs, car elle n’avait pas été diffusée auparavant. L’IA co-scientifique de Google a proposé cinq hypothèses pour répondre à notre question et la plus plausible selon le système coïncidait exactement avec notre hypothèse, que nous avons maintenant confirmée expérimentalement », explique le professeur Penadés.
L’équipe du professeur Penadés a constaté que le nouvel outil d’IA co-scientifique conçu par Google est capable d’analyser correctement toutes les preuves scientifiques publiées, de formuler diverses hypothèses et de suggérer des expériences pour les valider, le tout en un temps record. « L’IA a non seulement été capable de proposer une hypothèse avérée, que nous n’arrivions pas à comprendre depuis des années, mais elle en a également généré d’autres sur lesquelles nous travaillons actuellement », explique M. Penadés.
« L’IA co-scientifique de Google nous a donné en seulement deux jours l’hypothèse même que nous avons vérifiée après sept ans de travail. Nous sommes convaincus que cet outil accélèrera considérablement les progrès de la science, en transformant la manière dont nous générons et testons les hypothèses scientifiques ».
Validé sur la base d’une étude non publiée
Les recherches testant le potentiel de l’IA co-scientifique de Google ont permis de détecter un nouveau mécanisme de transfert de gènes entre bactéries. Le groupe du professeur José R. Penadés avait observé l’existence d’une famille de virus satellites présents dans différentes espèces bactériennes. Après plusieurs années de recherche, le groupe a décrypté le mécanisme expliquant ce phénomène : ces satellites sont capables de se lier aux tiges de différents virus, qui peuvent infecter différentes espèces bactériennes. En fonction de la tige acquise, les satellites pouvaient cibler une espèce ou une autre.
Une fois le mécanisme établi, lorsque l’équipe du professeur Penadés a interrogé l’IA co-scientifique sur les mécanismes possibles pouvant expliquer la présence de satellites identiques chez plusieurs espèces, la réponse a été qu’il fallait analyser la capacité de ces satellites à interagir avec différentes tiges ayant des tropismes bactériens différents. « Lorsque j’ai reçu les résultats, j’ai eu une sorte de choc. La seule chose que je pouvais penser était que le système avait accédé à mon ordinateur. Non seulement parce que la première hypothèse était correcte, mais aussi parce qu’elle suggérait d’autres idées auxquelles nous n’avions jamais pensé auparavant », explique le professeur Penadés.
La première idée suggérée par l’IA de Google en réponse à la question posée par l’équipe du Dr Penadés coïncidait parfaitement avec l’hypothèse sur laquelle son groupe travaillait depuis des années et qui a été récemment validée expérimentalement. Cette découverte, qu’ils s’apprêtent à publier dans l’une des revues scientifiques les plus prestigieuses au monde, n’était pas connue du système d’IA.
Potentiel de stimulation de la science
Les conclusions de l’équipe de recherche du professeur Penadés sur les voies de transfert de matériel génétique entre bactéries de différentes espèces, à laquelle participent des chercheurs de l’Imperial College et du CEU UCH, sont essentielles pour comprendre la capacité d’évolution des bactéries et les mécanismes qui les rendent plus virulentes et plus résistantes aux antibiotiques, ce qui constitue l’un des défis sanitaires les plus alarmants à l’échelle mondiale.
« Il est vrai que cette plateforme d’IA co-scientifique de Google n’en est qu’à ses débuts, mais nous pouvons déjà constater qu’elle a le potentiel de faire avancer la science. Face aux défis urgents qui se profilent à l’horizon en matière de santé mondiale, tels que la résistance aux antimicrobiens, il est clair que nous devons faire plus avec moins et accélérer nos découvertes. L’IA peut nous aider à exploiter les ressources limitées de nos laboratoires. Elle peut agir non seulement comme un outil, mais aussi comme un moteur créatif, accélérant la découverte et remodelant la façon dont nous générons et testons les hypothèses scientifiques », déclare M. Penadés.
Diffusion des résultats
Le pré-tirage de l’article qui a prouvé l’efficacité de l’IA co-scientifique de Google, en attendant l’examen final et la publication, est intitulé « Chimeric infective particles expand species boundaries in phage inducible chromosomal island mobilization », et a été réalisé par des chercheurs de l’Imperial College de Londres, de l’université CEU Cardenal Herrera (CEU UCH) et de l’Institut de biomédecine de Valence (IBV). Il est provisoirement disponible sous forme de pré-tirage à l’adresse suivante : https://doi.org/10.1101/2025.02.11.637232.
Hier après-midi, Google a publié les résultats de ce test de son outil d’IA co-scientifique dans l’article « Towards an AI co-scientist », auquel ont participé des chercheurs de l’Imperial College, de la Fleming Initiative et de l’université de Stanford, entre autres.
